Selon la revue Science, les biocarburants issus de sources ligno-cellulosiques (bois, feuilles, paille, etc.) provoqueront des émissions de carbone plus élevées que l'essence par unité énergétique, en moyenne sur la période 2000-2030. Dans l'article publié le 22 octobre, Jerry Melillo, du Laboratoire américain de biologie marine, explique que les terres nécessaires pour cultiver des arbres à croissance rapide et des feuillus déplaceront des cultures alimentaires et provoqueront une déforestation pour faire de la place à de nouvelles superficies agricoles, provoquant d'importantes émissions de gaz à effet de serre. Jerry Melillo n'affirme toutefois pas que les biocarburants de deuxième génération n'ont pas leur rôle à jouer dans les combats contre le réchauffement climatique. « Nous devons analyser avec soin les conséquences à court et long terme », observe-t-il.